MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Variovorax paradoxus B4 chromosome 1

Total Repeats: 148695

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022247	AGC	2	6	171	176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392232
2	NC_022247	GAC	2	6	218	223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392232
3	NC_022247	GCC	2	6	299	304	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392232
4	NC_022247	GAG	2	6	437	442	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	538392232
5	NC_022247	TGG	2	6	498	503	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538392232
6	NC_022247	GC	4	8	524	531	0 %	0 %	50 %	50 %	538392232
7	NC_022247	CGC	3	9	529	537	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392232
8	NC_022247	CGG	2	6	589	594	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392232
9	NC_022247	CTCG	2	8	757	764	0 %	25 %	25 %	50 %	538392232
10	NC_022247	CGA	2	6	778	783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392232
11	NC_022247	TTC	2	6	791	796	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538392232
12	NC_022247	CAA	2	6	799	804	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	538392232
13	NC_022247	CGCA	2	8	809	816	25 %	0 %	25 %	50 %	538392232
14	NC_022247	GAA	2	6	818	823	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538392232
15	NC_022247	TTC	2	6	824	829	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538392232
16	NC_022247	CTG	2	6	845	850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392232
17	NC_022247	AAG	2	6	854	859	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538392232
18	NC_022247	TGA	2	6	870	875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538392232
19	NC_022247	GCC	2	6	961	966	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392232
20	NC_022247	CAA	2	6	997	1002	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	538392232
21	NC_022247	GC	4	8	1004	1011	0 %	0 %	50 %	50 %	538392232
22	NC_022247	CTT	2	6	1042	1047	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538392232
23	NC_022247	GC	3	6	1151	1156	0 %	0 %	50 %	50 %	538392232
24	NC_022247	CTG	2	6	1172	1177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392232
25	NC_022247	AGA	2	6	1215	1220	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538392232
26	NC_022247	ACT	2	6	1230	1235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538392232
27	NC_022247	CGG	2	6	1363	1368	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392232
28	NC_022247	ACCAC	2	10	1374	1383	40 %	0 %	0 %	60 %	538392232
29	NC_022247	CAG	2	6	1421	1426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392232
30	NC_022247	CAG	2	6	1442	1447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392232
31	NC_022247	CGC	2	6	1605	1610	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392233
32	NC_022247	GGCA	2	8	1623	1630	25 %	0 %	50 %	25 %	538392233
33	NC_022247	CGG	2	6	1686	1691	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392233
34	NC_022247	CAGCTG	2	12	1693	1704	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	538392233
35	NC_022247	ACC	2	6	1705	1710	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538392233
36	NC_022247	CAC	2	6	1734	1739	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538392233
37	NC_022247	CGG	2	6	1749	1754	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392233
38	NC_022247	CAC	3	9	1770	1778	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538392233
39	NC_022247	GC	4	8	1784	1791	0 %	0 %	50 %	50 %	538392233
40	NC_022247	GCCG	2	8	1818	1825	0 %	0 %	50 %	50 %	538392233
41	NC_022247	GGC	2	6	1873	1878	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392233
42	NC_022247	GCCG	2	8	1905	1912	0 %	0 %	50 %	50 %	538392233
43	NC_022247	GCC	2	6	1936	1941	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392233
44	NC_022247	TTCG	2	8	2001	2008	0 %	50 %	25 %	25 %	538392233
45	NC_022247	CTA	2	6	2031	2036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538392233
46	NC_022247	AGC	2	6	2069	2074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392233
47	NC_022247	TGG	2	6	2081	2086	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538392233
48	NC_022247	TCG	2	6	2113	2118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392233
49	NC_022247	TTC	2	6	2156	2161	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538392233
50	NC_022247	CTG	2	6	2191	2196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392233
51	NC_022247	AAC	2	6	2233	2238	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	538392233
52	NC_022247	CGG	2	6	2256	2261	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392233
53	NC_022247	CG	3	6	2353	2358	0 %	0 %	50 %	50 %	538392233
54	NC_022247	GCT	2	6	2361	2366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392233
55	NC_022247	GCATC	2	10	2447	2456	20 %	20 %	20 %	40 %	538392233
56	NC_022247	AAC	2	6	2458	2463	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	538392233
57	NC_022247	CGG	2	6	2505	2510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392233
58	NC_022247	ACCT	2	8	2539	2546	25 %	25 %	0 %	50 %	538392233
59	NC_022247	AGA	2	6	2675	2680	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538392233
60	NC_022247	AGA	2	6	2819	2824	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538392234
61	NC_022247	AAGC	2	8	2825	2832	50 %	0 %	25 %	25 %	538392234
62	NC_022247	CGCC	2	8	2899	2906	0 %	0 %	25 %	75 %	538392234
63	NC_022247	GGT	2	6	3029	3034	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538392234
64	NC_022247	CGA	2	6	3047	3052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392234
65	NC_022247	GGCC	2	8	3059	3066	0 %	0 %	50 %	50 %	538392234
66	NC_022247	CGA	2	6	3071	3076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392234
67	NC_022247	TCG	2	6	3079	3084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392234
68	NC_022247	GAC	2	6	3156	3161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392234
69	NC_022247	GGC	2	6	3216	3221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392234
70	NC_022247	GGC	2	6	3252	3257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392234
71	NC_022247	GGCGTG	2	12	3264	3275	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	538392234
72	NC_022247	TGC	2	6	3301	3306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392234
73	NC_022247	ATC	2	6	3417	3422	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538392234
74	NC_022247	AAC	2	6	3543	3548	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	538392234
75	NC_022247	GAC	2	6	3591	3596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392234
76	NC_022247	CCGGCG	2	12	3601	3612	0 %	0 %	50 %	50 %	538392234
77	NC_022247	TCA	2	6	3634	3639	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538392234
78	NC_022247	CGG	2	6	3707	3712	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392234
79	NC_022247	GCAC	2	8	3721	3728	25 %	0 %	25 %	50 %	538392234
80	NC_022247	CAA	2	6	3791	3796	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	538392234
81	NC_022247	CGG	2	6	3812	3817	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392234
82	NC_022247	CACC	2	8	3818	3825	25 %	0 %	0 %	75 %	538392234
83	NC_022247	GC	3	6	3836	3841	0 %	0 %	50 %	50 %	538392234
84	NC_022247	TCA	2	6	3856	3861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538392234
85	NC_022247	CGA	2	6	3917	3922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392234
86	NC_022247	TGC	2	6	3939	3944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392234
87	NC_022247	GC	4	8	4016	4023	0 %	0 %	50 %	50 %	538392234
88	NC_022247	TCG	2	6	4036	4041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392234
89	NC_022247	GCT	2	6	4046	4051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392234
90	NC_022247	ACG	2	6	4078	4083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392234
91	NC_022247	ATC	2	6	4089	4094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538392234
92	NC_022247	TCG	2	6	4105	4110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392234
93	NC_022247	CG	3	6	4133	4138	0 %	0 %	50 %	50 %	538392234
94	NC_022247	CGC	2	6	4158	4163	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392234
95	NC_022247	TGG	2	6	4246	4251	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538392234
96	NC_022247	CCG	2	6	4261	4266	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392234
97	NC_022247	GC	3	6	4347	4352	0 %	0 %	50 %	50 %	538392234
98	NC_022247	GCT	2	6	4361	4366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392234
99	NC_022247	GAT	2	6	4388	4393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538392234
100	NC_022247	CCA	2	6	4429	4434	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538392234
101	NC_022247	GCGG	2	8	4437	4444	0 %	0 %	75 %	25 %	538392234
102	NC_022247	GAC	2	6	4452	4457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392234
103	NC_022247	ACC	2	6	4480	4485	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538392234
104	NC_022247	CAT	4	12	4487	4498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538392234
105	NC_022247	CCGACG	2	12	4501	4512	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	538392234
106	NC_022247	GCT	3	9	4535	4543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392234
107	NC_022247	CTT	2	6	4547	4552	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538392234
108	NC_022247	GCC	2	6	4604	4609	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392234
109	NC_022247	CGG	2	6	4715	4720	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392234
110	NC_022247	ACC	2	6	4731	4736	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538392234
111	NC_022247	GCG	2	6	4741	4746	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392234
112	NC_022247	GC	3	6	4764	4769	0 %	0 %	50 %	50 %	538392234
113	NC_022247	CG	3	6	4796	4801	0 %	0 %	50 %	50 %	538392234
114	NC_022247	GC	3	6	4832	4837	0 %	0 %	50 %	50 %	538392234
115	NC_022247	CTCGAC	2	12	4857	4868	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	538392234
116	NC_022247	ACC	2	6	4929	4934	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538392234
117	NC_022247	GCCG	2	8	4940	4947	0 %	0 %	50 %	50 %	538392234
118	NC_022247	AGC	2	6	4953	4958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392234
119	NC_022247	TGC	2	6	4987	4992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392234
120	NC_022247	GCC	3	9	4999	5007	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392234
121	NC_022247	AGC	2	6	5025	5030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392234
122	NC_022247	CGC	2	6	5066	5071	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392234
123	NC_022247	AGC	2	6	5109	5114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392234
124	NC_022247	CCG	2	6	5129	5134	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392234
125	NC_022247	GGCGAA	2	12	5136	5147	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	538392234
126	NC_022247	GAA	2	6	5157	5162	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538392234
127	NC_022247	ACC	2	6	5277	5282	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538392234
128	NC_022247	GCC	2	6	5299	5304	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392234
129	NC_022247	TGC	2	6	5305	5310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392234
130	NC_022247	CGA	2	6	5321	5326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392234
131	NC_022247	CGA	2	6	5366	5371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392234
132	NC_022247	CCGCG	2	10	5379	5388	0 %	0 %	40 %	60 %	538392234
133	NC_022247	GCGG	2	8	5411	5418	0 %	0 %	75 %	25 %	538392234
134	NC_022247	GAT	2	6	5440	5445	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538392235
135	NC_022247	CCG	2	6	5466	5471	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392235
136	NC_022247	CTG	2	6	5481	5486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392235
137	NC_022247	GT	3	6	5588	5593	0 %	50 %	50 %	0 %	538392235
138	NC_022247	GCGA	2	8	5607	5614	25 %	0 %	50 %	25 %	538392235
139	NC_022247	CTG	3	9	5631	5639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392235
140	NC_022247	CGC	2	6	5640	5645	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392235
141	NC_022247	GCT	2	6	5655	5660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392235
142	NC_022247	CG	3	6	5675	5680	0 %	0 %	50 %	50 %	538392235
143	NC_022247	AGC	2	6	5814	5819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392235
144	NC_022247	GATGG	2	10	5860	5869	20 %	20 %	60 %	0 %	538392235
145	NC_022247	GGC	2	6	5902	5907	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392235
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147	NC_022247	TGC	2	6	6192	6197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392236
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149	NC_022247	CG	3	6	6212	6217	0 %	0 %	50 %	50 %	538392236
150	NC_022247	CG	3	6	6219	6224	0 %	0 %	50 %	50 %	538392236
151	NC_022247	CCG	2	6	6230	6235	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392236
152	NC_022247	CGC	2	6	6244	6249	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392236
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154	NC_022247	GCG	2	6	6272	6277	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392236
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157	NC_022247	AGCG	2	8	6299	6306	25 %	0 %	50 %	25 %	538392236
158	NC_022247	CAG	2	6	6322	6327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392236
159	NC_022247	GCG	2	6	6379	6384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392236
160	NC_022247	CAG	2	6	6783	6788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392237
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163	NC_022247	CGC	2	6	6912	6917	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392237
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165	NC_022247	GC	3	6	6954	6959	0 %	0 %	50 %	50 %	538392237
166	NC_022247	GC	3	6	6979	6984	0 %	0 %	50 %	50 %	538392237
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168	NC_022247	CG	3	6	7057	7062	0 %	0 %	50 %	50 %	538392237
169	NC_022247	ACG	2	6	7080	7085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392237
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172	NC_022247	GC	3	6	7235	7240	0 %	0 %	50 %	50 %	538392237
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178	NC_022247	CCG	2	6	7478	7483	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392238
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184	NC_022247	GGC	2	6	7798	7803	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392238
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199	NC_022247	CGG	2	6	8457	8462	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392239
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203	NC_022247	GGCC	2	8	8683	8690	0 %	0 %	50 %	50 %	538392239
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220	NC_022247	GCA	2	6	9097	9102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392239
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223	NC_022247	GCT	2	6	9211	9216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392239
224	NC_022247	GC	3	6	9230	9235	0 %	0 %	50 %	50 %	538392239
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230	NC_022247	GCT	2	6	9507	9512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392240
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233	NC_022247	CAG	2	6	9666	9671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392240
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235	NC_022247	GGCG	2	8	9725	9732	0 %	0 %	75 %	25 %	538392240
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238	NC_022247	GCC	2	6	9981	9986	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392241
239	NC_022247	CTG	2	6	10008	10013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538392241
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241	NC_022247	GGC	2	6	10092	10097	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392241
242	NC_022247	CGC	2	6	10135	10140	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392241
243	NC_022247	GC	3	6	10159	10164	0 %	0 %	50 %	50 %	538392241
244	NC_022247	CGG	2	6	10277	10282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392241
245	NC_022247	GGC	2	6	10305	10310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392241
246	NC_022247	GCA	2	6	10445	10450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392241
247	NC_022247	AAG	2	6	10470	10475	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538392241
248	NC_022247	GCC	2	6	10546	10551	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392242
249	NC_022247	CG	4	8	10557	10564	0 %	0 %	50 %	50 %	538392242
250	NC_022247	GTA	2	6	10613	10618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538392242
251	NC_022247	CAG	2	6	10634	10639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392242
252	NC_022247	CAG	2	6	10646	10651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392242
253	NC_022247	GTGA	2	8	10724	10731	25 %	25 %	50 %	0 %	538392242
254	NC_022247	CGCC	2	8	10735	10742	0 %	0 %	25 %	75 %	538392242
255	NC_022247	CCA	2	6	10750	10755	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538392242
256	NC_022247	GCA	2	6	10756	10761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392242
257	NC_022247	GCA	2	6	10795	10800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392242
258	NC_022247	CGC	2	6	10813	10818	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392242
259	NC_022247	CAG	4	12	10955	10966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538392242
260	NC_022247	CGGC	2	8	11011	11018	0 %	0 %	50 %	50 %	538392242
261	NC_022247	CAGAAG	2	12	11031	11042	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	538392242
262	NC_022247	CCA	3	9	11053	11061	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538392242
263	NC_022247	CG	3	6	11101	11106	0 %	0 %	50 %	50 %	538392242
264	NC_022247	ACGCC	2	10	11155	11164	20 %	0 %	20 %	60 %	538392242
265	NC_022247	CCA	2	6	11167	11172	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538392242
266	NC_022247	TGA	2	6	11203	11208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538392242
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271	NC_022247	GC	3	6	11308	11313	0 %	0 %	50 %	50 %	538392242
272	NC_022247	GCCA	2	8	11316	11323	25 %	0 %	25 %	50 %	538392242
273	NC_022247	GC	4	8	11341	11348	0 %	0 %	50 %	50 %	538392242
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289	NC_022247	GGC	2	6	12120	12125	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392243
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387	NC_022247	GGCCGG	2	12	16000	16011	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538392247
388	NC_022247	CCG	2	6	16293	16298	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392248
389	NC_022247	TCA	2	6	16351	16356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538392248
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391	NC_022247	TGGT	2	8	16428	16435	0 %	50 %	50 %	0 %	538392248
392	NC_022247	CG	3	6	16442	16447	0 %	0 %	50 %	50 %	538392248
393	NC_022247	CAC	2	6	16451	16456	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538392248
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500	NC_022247	CGC	2	6	20449	20454	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538392252

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